تقع جزيرة طنب الصغرى إلى الشمال الغربي من جزيرة ابو موسى ، وتبعد عن الساحل العربي نحو 90 كيلو متراً ، كما إنها على بعد 12 كيلو مترات إلى الغرب من جزيرة طنب الكبرى ، كما إنها تبعد عن الساحل الشرقي للخليج تقريبا 43 كيلو مترا ، وعن الساحل الغربي حوالي 81 كيلو متراً ، وهي تبدو على شكل مثلث ويبلغ طولها نحو 2 كيلو متراً ،  وعرضها كيلو متر واحد .

إن جزيرة طنب الصغرى تتكون مـن ثلاث تلال داكنة اللون تقع في طرفها الشمالي ، وهي ذات طبيعة صخرية ، ويبلغ أقصى ارتفاع في الجزيرة حوالي 116 مترا ، وفي الماضي كل يلجأ إليها الصيادون عند هبوب الرياح وعلو الأمواج ريثما يهدأ البحر ليستمروا في نشاطهم البحري ، ويتابعوا خط سيرهم بعد الاستراحة على ارض هذه الجزيرة ، وتكثر في الجزيرة أعشاش الطيور البحرية ، وهي غنية بالنفط كما أشارت التقارير الأولية لبعثات التنقيب ، وهي جزيرة لم تكن مأهولة بالسكان في الماضي ، وذلك لانعدام الموارد المائية فيها .

تتمتع هذه الجزر بمناخ صحراوي حار جزري حيث ترتفع الرطوبة ، وتتسم المنطقة بصيف طويل حار وشتاء قصير رطب .

أما اتجاه الرياح في معظم فصول السنة إلى اسفل الخليج من الشمال الغربي إلى الجنوب الغربي ، كما إن الرياح السائدة هي الرياح الشمالية الغربية وهي تلطف الجو في الموسم الحار ، وتهب ريح الشمال بانتظام وتسمى باسم البارح ، كما تهب رياح أخرى مثل الكوس والنعشي والياهي والبحري .

الأمطار قليلة وينحصر سقوطها في اشهر الشتاء ، ويسقط اغلب المطر في أشهر ديسمبر ويناير وفبراير ، ولا يزيد معدل سقوط الأمطار عن 5 بوصات سنويا .